Der Zweckverband handelt durch die Mitgliederversammlung, Leitungsorgan des Zweckverbandes, den Verbandsvorstand und die Geschäftsführung als hauptamtliche Führung der laufenden Geschäfte.
Mitglieder im Vorstand:
Herr Dr. Bernhard Liess, Stadtdekan, Vorstandsvorsitzender
Pfarrerin Mirjam Pfeiffer, stv. Vorstandsvorsitzende
Frau Stephanie Reis, Mitglied Vorstand
Pfarrerin Anne Bomblies, Mitglied Vorstand
Mitglieder der Mitgliederversammlung des EKiM kirchlichen Zweckverbands:
Stadtdekan Bernhard Liess
Diakon Dietmar Frey
St. Markus Kreuzkirche, München
Pfarrerin Elke Wewetzer
Sabine Fastert
Trinitatiskirche, Oberschleißheim
Pfarrerin Martina Buck
Irene Beck
Laudatekirche, Garching
Pfarrerin Kathrin Frohwein
Zachäuskirche, Gröbenzell
Pfarrerin Susanne Kießling-Prinz
Stefanie Reis
Jesuskirche, Haar
Pfarrerin Annedore Becker
Dr. Peter Lauffer
Genezareth Kirche, Unterschleißheim
Pfarrerin Mirijam Pfeiffer
Andreas Mann
Petrikirche, Baldham
Pfarrer Gereon Sedlmayr
Lätarekirche, München
Pfarrer Martin Decker
Sabine Ludwig
Dankeskirche München
Pfarrerin Anne Bomblies
Hagen Alvermann
Gesamtkirchengemeinde, Kinderhaus Andreas
Ruth Markwart-Kunast
Pfarrer Thomas Lotz
Nikodemuskirche München
Pfarrer Phillipp Gmelin
Dr. Theresa Trummler
Jerusalemkirche - Taufkirchen
Pfarrerin Silvia Beims
Bettina Ferber-Hrazdira
Korneliuskirche - Karlsfeld
Pfarrer Roman Breitwieser
Cornelia Handl